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viernes, 21 de enero 2022
21/01/2022
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Publicaciones

Artículos en revistas indexadas

  • Ramírez, M., Neuman, B.W., Ramírez C.A. 2020. Bacteriophages as promising agents for the biological control of Moko disease (Ralstonia solanacearum) of banana. Biologica control 149: 104238. Bajar archivo
  • Ramírez, M., Moncada, R.N., Villegas-Escobar. R.W., Jackson, R.W., y Ramírez, C.A. 2020. Phylogenetic and pathogenic variability of strains of Ralstonia solanacearum causing moko disease in Colombia. Plant pathology 69: 360-369. Bajar archivo.
  • Pérez-Jaramillo, J.E., de Hollander, Ramírez, C.A., Mendes, R. y Raaijmakers, J. 2019. Deciphering rhizosphere microbiobe assembly of wild and modern common bean (Phaseolus vulgaris) in native and agricultural soils from Colombia. Microbiome 7: 114-129. Bajar archivo.
  • Pérez-Jaramillo, J.E., Carrión, V., de Hollander, M. y Raaijmakers, J. 2018. The wild side of plant microbiomes. Microbiome 6: 143-148. Bajar archivo.
  • Pérez-Jaramillo, J.E., Carrión, V., Bosse, M., Ferrão, L., de Hollander, M., Garcia, A., Ramírez, C.A., Mendes, R. y Raaijmakers, J. 2017. Linking rhizosphere microbiome composition of wild and domesticated Phaseolus vulgaris to genotypic and root phenotypic traits. International Society for Microbial Ecology 1-14. Bajar archivo.
  • Pérez-Jaramillo, J.E., Mendes, R. y Raaijmakers, J. 2016. Impact of plant domestication on rhizosphere microbiome assembly and functions. Plant Molecular Biology 90: 635-644. Bajar archivo.
  • Posada, L., Ramírez, M., Ochoa, N., Cuellar, T., Argel, L., Ramírez, C.A. y Villegas, V. 2016. Bioprospecting of aerobic endospore-forming bacteria with biotechnological potential for growth promotion of banana plants. Scientia Horticulturae 212: 81-90. Bajar archivo.
  • Valverde, C., Ramírez, C.A., Kloepper, J.W., y Cassán, F. 2015. Current research on plant growth-promoting rhizobacteria in Latin America: Meeting report from the 2nd Latin American PGPR Workshop. Journal of Plant Growth Regulation 34(1): 1-5. Bajar archivo.
  • Salazar, D., Jaramillo, C., Vásquez, J., Ramírez, C.A. y Cardona, N.L. 2014. Antagonismo de Purpureocillium sp. (cepa UdeA0106) con hongos aislados de cultivos de flores. Actualidades Biológicas 36: 23-31. Bajar archivo.
  • Castillo, J.D., Lawrence, K.S., Morgan-Jones, G. y Ramírez, C.A. 2010. Identification of fungi associated with Rotylenchulus reniformis. Journal of Nematology 42(4): 313-318. Bajar archivo.
  • Ramírez, C.A. y Kloepper, J.W. 2010. Plant growth promotion by Bacillus amyloliquefaciens FZB45 depends on inoculum rate and P-related soil properties. Biology and Fertility of Soils 46(8): 835-844. Bajar archivo.

 

Artículos de divulgación

  • Suárez, A., Ramírez, M., Pérez, J.E., Cardona, N.L., Calle, J., y Ramírez, C.A. 2008. Poblaciones de bacterias totales y potencialmente deletéreas asociadas a la rizosfera de crisantemo cultivado en suelos tratados con vapor de agua. Revista ASOCOLFLORES 72:40-45. Bajar archivo.
  • Ramírez, C.A. 2003. Rizobacterias promotoras del crecimiento vegetal: Usos y potenciales. Boletín Técnico Cenibanano 3: 3 – 6. Bajar archivo.

 

Capítulos de libro

  • Burkett-Cadena, M., Ramírez, C.A., Liles, M. y Kloepper, J.W. 2013. Effect of agronomic practices on deleterious rhizosphere an endophytic bacteria. En: García de Salomone, I.E., Vázquez, S., Penna, C. y Cassán, F. (Ed). Rizosfera, Biodiversidad y Agricultura Sustentable. Asociación Argentina de Microbiología. ISBN: 978-987-26716-1-7. Pg 15-32. Bajar archivo.
  • Ramírez, C.A. y Kloepper, J.W. 2011. Rizobacterias promotoras del crecimiento vegetal. En: Hoyos, L.M. (Ed). Enfermedades de las plantas: Manejo biológico. Universidad Nacional de Colombia Sede Bogotá. ISBN 978-958-648-651-4. Pg 97-126. Bajar archivo.

 

Tesis

  • Botero, M.C. 2020. Experimental evolution of Bacillus velezensis UA-2008: a sight from the colony-type biofilm morphology. Trabajo de investigación presentado como requisito parcial para optar al título de Biólogo, Universidad de Antioquia, Medellín, Colombia. Asesores: Ramírez C.A. y Borrego, D.A. 27 p. Bajar archivo.
  • Pérez-Jaramillo, J.E. 2019. Impact of plant domestication on spermosphere and rhizosphere microbiome composition. Disertación sometida para optar al título de PhD en Biología, Universidad de Leiden, Holanda. Asesores: Raaijmakers, J. y Carrion, V. 241 p. Bajar archivo.
  • Mejía, D. y Posada, A. 2019. Aislamiento de Bacterias Aerobias Formadoras de Endospora (BAFEs) con rasgos promotores de crecimiento vegetal (PGPR) por selección mediada por hospedero. Trabajo de investigación presentado como requisito parcial para optar al título de Microbiólogo, Universidad de Antioquia, Medellín, Colombia. Asesores: Ramírez C.A. y Lozano, C.N. Bajar archivo.
  • Ramírez, M. 2018. Ralstonia solanacearum, agente causal del moko: su diversidad, potencial patogénico y fagoterapia en Colombia. Disertación sometida para optar al título de PhD en Biología, Universidad de Antioquia, Medellín, Colombia. Asesores: Ramírez, C.A., Villegas, V., Correa, J. y Jackson, R. 159 p. Bajar archivo.
  • Guerra, A. y Toro, A. 2018. Effect of Phaseolus vulgaris L. domestication on the symbiotic association with rhizobia. Trabajo de investigación presentado como requisito parcial para optar al título de Biólogo, Universidad de Antioquia, Medellín, Colombia. Asesores: Ramírez C.A. y Perez, J.E. Bajar archivo.
  • Muñoz, M. 2018. Impacto de la revegetalización en la rehabilitación temprana de suelos degradados en dos minas de caliza. Trabajo de investigación presentado como requisito parcial para optar al título de M.Sc. en Biología, Universidad de Antioquia, Medellín, Colombia. Asesor: Ramírez, C.A. Bajar archivo.
  • Montoya, N. 2018. Comparación de comunidades bacterianas asociadas a un proceso de revegetalización asistida y natural de suelos degradados por minería. Trabajo de investigación presentado como requisito parcial para optar al título de M.Sc. en Biología, Universidad de Antioquia, Medellín, Colombia. Asesor: Ramírez, C.A. Bajar archivo.
  • Guerra, A. y Henao, D. 2017. Potencial de una mezcla de bacteriófagos líticos nativos para el biocontrol de la marchitez bacteriana causada por Ralstonia solanacearum en plantas de tomate. Trabajo de investigación presentado como requisito parcial para optar al título de Microbiólogo, Universidad de Antioquia, Medellín, Colombia. Asesores: Ramírez C.A. y Ramírez, M. Bajar archivo.
  • Díaz, B. 2017. Comparación de rasgos asociados al crecimiento vegetal entre ecotipos del clado Bacillus subtilis. Trabajo de investigación presentado como requisito parcial para optar al título de Biólogo, Universidad de Antioquia, Medellín, Colombia. Asesores: Ramírez C.A. y Borrego, D.A. 28 p. Bajar archivo.
  • Lozano, C.N. 2017. Explorando el desempeño de bacterias aeróbicas formadoras de endospora para el control de antracnosis en mango. Trabajo de investigación presentado como requisito parcial para optar al título de M.Sc. en Biología, Universidad de Antioquia, Medellín, Colombia. Asesor: Ramírez, C.A. Bajar archivo.
  • Borrego, D.A. 2016. Evaluación de factores útiles para orientar la prospección de PGPR formadoras de endospora en maíz. Trabajo de investigación presentado como requisito parcial para optar al título de M.Sc. en Biotecnología, Universidad de Antioquia, Medellín, Colombia. Asesor: Ramírez, C.A. 67p. Bajar archivo.
  • Arango, D. y Cortés, A. 2016. Asociación entre características genómicas y los rasgos de promoción de crecimiento vegetal en PGPR-FE. Trabajo de investigación presentado como requisito parcial para optar al título de Microbiólogo, Universidad de Antioquia, Medellín, Colombia. Asesores: Ramírez C.A. y Borrego, D.A. 19 p. Bajar archivo.
  • Sánchez, M. 2016. Efecto del glifosato sobre las poblaciones de bacterias  totales y formadoras de endospora en un microcosmos de suelo. Trabajo de investigación presentado como requisito parcial para optar al título de Biólogo, Universidad de Antioquia, Medellín, Colombia. Asesores: Ramírez C.A. y Ramírez, M. Bajar archivo.
  • Suárez, A.M. 2014. Aislamiento y evaluación de rizobacterias para promover el crecimiento temprano de Brachiaria decumbens en un suelo degradado por minería. Trabajo de investigación presentado como requisito parcial para optar al título de M.Sc. en Biología, Universidad de Antioquia, Medellín, Colombia. Asesor: Ramírez, C.A. Bajar archivo.
  • Lopera, P. 2014. Efecto de la densidad de inóculo bacteriano y de algunas propiedades del suelo en el biocontrol de damping-off en tomate con PGPR-BAFE. Trabajo de investigación presentado como requisito parcial para optar al título de M.Sc. en Biología, Universidad de Antioquia, Medellín, Colombia. Asesor: Ramírez, C.A. Bajar archivo.
  • Morales, J. 2014. Selección de bacterias noduladoras para promover el crecimiento de dos leguminosas arbustivas en suelos degradados por minería. Trabajo de investigación presentado como requisito parcial para optar al título de M.Sc. en Biología, Universidad de Antioquia, Medellín, Colombia. Asesor: Ramírez, C.A. Bajar archivo.
  • Arenas, M. y Restrepo S. 2014. Evaluación de la capacidad biocontroladora de PGPR formadoras de endospora sobre damping-off en café. Trabajo de investigación presentado como requisito parcial para optar al título de Biólogo, Universidad de Antioquia, Medellín, Colombia. Asesores: Ramírez C.A. y Lozano, C.N. 76p. Bajar archivo.
  • Ramírez, M. 2012. Bacterias asociadas a raíces de Musa spp.: Densidad poblacional y potencial promotor de crecimiento vegetal. Trabajo de investigación presentado como requisito parcial para optar al título de M.Sc. en Biología, Universidad de Antioquia, Medellín, Colombia. Asesor: Ramírez, C.A. 116p. Bajar archivo.
  • Ramírez, C.A. 2010. Exploring the relation between plant phosphorus nutrition and growth promotion by Bacillus subtilis/amyloliquefaciens strains. Disertación sometida para optar al título de PhD, Auburn University, AL, USA. Asesor: Kloepper, J.W. 144p. Bajar archivo.
  • Lopera, P. 2009. Antagonismo in vitro e in vivo con Pseudomonas spp. fluorescentes y Bacillus spp. sobre Botrytis cinerea pers., aislados de suelo y material vegetal del cultivo Flores Silvestres S.A. C.I. Trabajo de grado para optar al título de Biólogo, Universidad de Antioquia, Medellín, Colombia. Asesores: Carodona, N. y Ramírez C.A. 84p. Bajar archivo.
  • Suárez, A.M. 2008. Determinación de poblaciones de rizobacterias con rasgos deletéreos asociadas a plantas de crisantemo en suelos del oriente antioqueño. Trabajo de grado para optar al título de Biólogo, Universidad de Antioquia, Medellín, Colombia. Asesores: Ramírez C.A. y Carodona, N. 53p. Bajar archivo.
  • Ramírez, M. 2008. Rizobacterias asociadas a crisantemo (Dendrathema grandiflora Tevelev) con potencial para promover crecimiento vegetal. Trabajo de grado para optar al título de Biólogo, Universidad de Antioquia, Medellín, Colombia. Asesores: Ramírez C.A. y Calle, J. 45p. Bajar archivo.
  • Pérez, J.E. 2007. Selección de mutantes espontáneos resistentes a rifampicina de rizobacterias aisladas de banano y plátano. Trabajo de grado para optar al título de Biólogo, Universidad de Antioquia, Medellín, Colombia. Asesores: Ramírez C.A. y Calle, J. 44p. Bajar archivo.
  • Ramírez, J.E. 2005. Aislamiento y evaluación de rizobacterias con potencial biocontrolador y promotor de crecimiento en plantas de banano. Trabajo de investigación presentado como requisito parcial para optar al título de M.Sc. en Biotecnología, Universidad Nacional de Colombia sede Medellín. Asesor: Pérez, J.C. 169p. Bajar archivo.

 

Resúmenes en eventos científicos

9th International and 1st Latin American PGPR Workshop, Medellín, Colombia

  • Posada, L.F., Argel, L.E., Ramírez, M., Ramírez, C.A., Mira, J.J., Romero, M. y Villegas, V. 2012. Bacillus subtilis EA-CBO0575: plant growth promoting bacteria of banana plants in greenhouse. Póster. Bajar archivo.
  • Ramírez, C.A. y Kloepper, J. 2012. Soil phosphorus modulation of early plant growth promotion by Bacillus subtilis/amyloliquefaciens stratins. Orador invitado. Bajar archivo.

XXXI Congreso Colombiano de Fitopatología, Pereira, Colombia

  • Ramírez, C.A., Lozano, C.N., Arenas, M., Restrepo, S., Hernandez, D. y Morales, J. 2013. Bacillus subtilis EA-CBO0575: plant growth promoting bacteria of banana plants in greenhouse. Ponencia. Bajar archivo.
  • Ramírez, M., Villegas, V., Mira, J.J. y Ramírez, C.A. 2013. Cambios en la estructura poblacional de bacterias con rasgos PGPR formadoras de endospora asociados a la aplicación de glifosato. Ponencia. Bajar archivo.
  • Lozano, C.N. y Ramírez, C.A. 2013. Aislamientos y selección de cepas de bacterias aeróbicas formadoras de endospora para el control de antracnosis en frutos de mango. Ponencia. Bajar archivo.
  • Lopera, P., Burkett, M.  y Ramírez, C.A. 2013. Variabilidad en el efecto de aislados de rizobacterias formadoras de endospora en la promoción del crecimiento de tomate. Ponencia. Bajar archivo.

 II Workshop Latinomericano sobre PGPR, Córdoba, Argentina

  • Ramírez, C.A. 2014. PGPR use in agriculture. The experience from Colombia. Miniconferencia.Bajar archivo.
  • Súarez, A.M., Acevedo, N.J., y Ramírez, C.A. 2014. Prospecting for rhizobacteria to promote growth of Brachiaria decumbens in mine tailings. Póster. Bajar archivo.
  • Morales, J., Acevedo, N.J., y Ramírez, C.A. 2014. Prospecting for rhizobia associated with two shrub legumes useful for revegetation of mine-degraded soils. Póster. Bajar archivo.
  • Lopera, P., Burkett, M., Osorio, N.W. y Ramírez, C.A. 2014. Effect of soil properties and inoculum concentration on the effectivenes of endospore-forming PGPR to control Rhizoctonia damping-off in tomato. Póster. Bajar archivo.

XVII Congreso Colombiano de la Ciencia del Suelo, Popayán, Colombia

  • Ramírez, C.A. 2014. Retos y avances en el uso de PGPR con fines agrícolas y ambientales. Conferencia.Bajar archivo
  • Arenas, M., Restrepo, S., Lozano, C.N. y Ramírez, C.A. 2014. Efecto de aislados PGPR formadores de endospora sobre café en etapas de germinación y almácigo. Ponencia. Bajar archivo.
  • Lopera, P., Burkett, M., Osorio, N.W. y Ramírez, C.A. 2014. Efecto de las propiedades del suelo en el biocontrol de damping-off en tomate con PGPR-BAFE. Ponencia. Bajar archivo.
  • Súarez, A.M., Acevedo, N.J., y Ramírez, C.A. 2014. Prospección de rizobacterias para promover el crecimiento de Brachiaria decumbens en un suelo degradado por minería. Ponencia. Bajar archivo.
  • Morales, J., Acevedo, N.J., y Ramírez, C.A. 2014. Prospección de rizobios asociados a dos leguminosas arbustivas útiles para la revegetalización de suelos degradados. Ponencia. Bajar archivo.

XVII Congreso Latinoamericano de Microbiología y 4 Congreso Colombiano de Microbiología, Cartagena, Colombia  

  • Ramírez, C.A. 2014. El reto de clasificar bacterias y su importancia para la agricultura. Conferencia. Bajar archivo.

10th International PGPR Workshop, Liège, Bélgica

  • Ramírez, C.A., Borrego D.A., Suárez, A.M., Camelo, C. y D. 2015. Prospecting for endospore-forming PGPR:Revisiting the guiding principles. Conferencia. Bajar archivo.

XXXII Colombian Congress of Phytopathology & 1 International Symposium of Fusarium, Bogotá, Colombia 

  • Arenas, M., Restrepo, S., Lozano, C.N. y Ramírez, C.A. 2015. Use of endospore-forming PGPR as an alternative to control Rhizoctonia Damping-Off of coffee. Ponencia. Bajar archivo.
  • Sánchez, M., Ramírez, M. y Ramírez, C.A. 2015. Endospore-forming bacteria in a soil microcosm. Ponencia. Bajar archivo.
  • Ramírez, M., Villegas, V., Correa, J., Jackson, R. y Ramírez, C.A. 2015. Prospecting for lytic bacteriophages against diverse strains of Ralstonia solanacearum from Musa spp. in Colombia. Ponencia. Bajar archivo.

APS annual meeting, Tampa, Florida, USA 

  • Ramírez, M., Jackson, R., Villegas, V., Correa, J. y Ramírez, C.A. 2016. Diversity and phylogeny of moko disease-causing Ralstonia solanacearum strains in Colombia. Póster. Bajar archivo.

Taller "Biodiversidad microbiana nativa" - CEAZA, La Serena, Chile 

  • Ramírez, C.A. 2016. Prospección y uso de bacterias benéficas para promover la revegetalización de suelos degradados por minería. Ponencia. Bajar archivo.

XXXIII Congreso Colombiano de Fitopatología y Ciencias Afines, Palmira, Colombia

  • Ramírez, M., Villegas, V. y Ramírez, C.A. 2017. Existencia en Colombia de diferentes linajes y variantes patogénicas de Ralstonia solanacearum asociadas a moko en banano y plátano. Ponencia. Bajar archivo.
  • Ramírez, M., Villegas, V. y Ramírez, C.A. 2017. Bacteriófagos líticos para el biocontrol de moko (Ralstonia solanacearum) en banano: prospección y efectividad en invernadero. Ponencia. Bajar archivo.
  • Lozano, C.N., Hierrezuelo, J., Romero, D. y Ramírez, C.A. 2017. Biocontrol de antracnosis en frutos de mango por (Bacillus subtilis/amyloliquefaciens) en postcosecha. Ponencia. Bajar archivo.
  • Guerra, B.A., Henao, D.C., Ramírez, M. y Ramírez, C.A. 2017. Biocontrol de Ralstonia solanacearum por bacteriófagos líticos en plántulas de tomates a nivel de invernader. Ponencia. Bajar archivo.

IV Latinamerican PGPR Workshop, Foz do Iguaçu, Brasil 

  • Morales, J.D., Suárez, A.M., Muñoz, M., Montoya, N., Acevedo, N.J., Ramírez, C.A. 2018.  Revegetation approaches of degraded soils by open-pit mining through useful plants and beneÞ cial microorganisms. Póster.  Bajar archivo.
  • Borrego, D.A., Uribe, D., Ramírez, C.A. 2018.  Ecotypes theory for the identification of bacterial groups with potential PGPR traits in Bacillus subtilis/amyloliquefaciens. Póster. Bajar archivo.

XXXIV Congreso Colombiano de Fitopatología y Ciencias Afines, Bogotá, Colombia

  • Arango, D., Acevedo, N., Córdoba, O., Ramírez, C.A. 2019. Efecto de la sequía sobre la fisiología y desarrollo de Vachellia farnesiana en simbiosis con rizobios. Fitopatología Colombiana 43(2): 226. Ponencia. Bajar archivo.
  • Borrego, D.A., Dunlap, C., Ramírez, C.A. 2019. Variabilidad genómica y su asociación en rasgos potenciales al biocontrol en Bacillus velezensis. Fitopatología Colombiana 43(2): 233. Ponencia. Bajar archivo.
  • Cárdenas, D.M., Borrego, D.A. y Ramírez, C.A.  2019.  Variabilidad de la interacción in vitro de cepas de Bacillus velezensis y Trichoderma spp. Ponencia. Bajar archivo.
  • Morales, J.D. y  Ramírez, C.A. 2019. Aproximaciones experimentales en el aislamiento y producción de bacteriófagos líticos a pequeña escala para el biocontrol bacterias fitopatógenas. Ponencia. Bajar archivo.
  • Pantoja, M y Ramírez, C.A. 2019. Respuesta diferencial de plantas de maíz y pepino a la acción de la rizobacteria promotora de crecimiento (PGPR) Lysinibacillus sp. PB211. Ponencia. Bajar archivo.

Conferencias y otros materiales en video

Nota: Estas son conferencias ofrecidas por investigadores de nuestro grupo. En nuestro canal de YouTube puede encontrar charlas ofrecidas por conferencistas invitados dentro de nuestras actividades de Extensión. 

  • Ecosistemas alterados y pandemias. Conversatorio entre la profesora del Instituto de Biología Cristina López y el profesor Camilo Ramírez, organizado por el Parque Explora de Medellín. Mayo 6 de 2020. Ver video

  • Situación actual en el uso de bacterias benéficas en cultivos. Conferencista: Camilo Ramírez. Programa de conferencias de la Asociación Colombiana de Fitopatología - ASCOLFI. Noviembre 6 de 2020. Ver video.

  • Importancia de la teoría evolutiva en microbiología aplicada. Conferencista: David Borrego. Programa de capacitación continua a egresados del Departamento de Microbiología de la Universidad Popular del Cesar (UPC). Diciembre 17 de 2020. Ver video.

  • Producción bacteriana de auxinas: Un rasgo clave en la actividad de inoculantes bacterianos de interés agrícola. Conferencista: Manuel Pantoja. Conferencias BA&A. Marzo 5 de 2021. Ver video.

  • Efecto de la simbiosis con Ensifer spp. sobre la respuesta de plantas jóvenes de Vachellia farnesiana al estrés hídrico. Conferencista: David Arango. Conferencias BA&A. Junio 11 de 2021. Ver video.

 

Conversatorios y otros materiales en audio

  • Evolución viral: tres científicos un tema. Conversatorio entre los profesores de la Universidad de Antioquia Juan Carlos Gallego y Camilo Ramírez, y el Doctor Richard Hoyos, organizado por el Parque Explora de Medellín. Abril 17 de 2020. Escuchar audio.

 

 

 
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